18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2898 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2898  ketosteroid isomerase-like protein  100 
 
 		 153 aa  318  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0113  ketosteroid isomerase-like protein  44.72 
 
 		 212 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3358  ketosteroid isomerase-related protein-like protein  45.38 
 
 		 141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1891  hypothetical protein  45.45 
 
 		 140 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.239366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1469  hypothetical protein  43.45 
 
 		 175 aa  123  9e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.716507  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1210  ketosteroid isomerase-like protein  38.64 
 
 		 167 aa  118  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.187179  normal  0.389634 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4363  ketosteroid isomerase-related protein-like protein  39.32 
 
 		 135 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02403  hypothetical protein  42.02 
 
 		 284 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5451  hypothetical protein  32.88 
 
 		 165 aa  99  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.454717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3634  protein of unknown function DUF1486  34.96 
 
 		 143 aa  86.3  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1640  hypothetical protein  28.24 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0534707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1969  hypothetical protein  28.69 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.383459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0376  Limonene-12-epoxide hydrolase  28.7 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.378531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1317  protein of unknown function DUF1486  33.9 
 
 		 138 aa  45.1  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26628  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1111  hypothetical protein  25.81 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5856  protein of unknown function DUF1486  29.82 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0063  hypothetical protein  26.92 
 
 		 158 aa  42  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5869  protein of unknown function DUF1486  25.23 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>