17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1210 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1210  ketosteroid isomerase-like protein  100 
 
 		 167 aa  334  2.9999999999999997e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.187179  normal  0.389634 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1469  hypothetical protein  67.74 
 
 		 175 aa  191  5e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.716507  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5451  hypothetical protein  55.15 
 
 		 165 aa  167  6e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.454717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1891  hypothetical protein  52.34 
 
 		 140 aa  152  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.239366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3358  ketosteroid isomerase-related protein-like protein  49.23 
 
 		 141 aa  147  6e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0113  ketosteroid isomerase-like protein  48.03 
 
 		 212 aa  140  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4363  ketosteroid isomerase-related protein-like protein  46.77 
 
 		 135 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2898  ketosteroid isomerase-like protein  38.64 
 
 		 153 aa  117  7e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02403  hypothetical protein  32.81 
 
 		 284 aa  84.7  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1969  hypothetical protein  29.01 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.383459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1640  hypothetical protein  28.03 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0534707  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3634  protein of unknown function DUF1486  27.12 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1317  protein of unknown function DUF1486  30.14 
 
 		 138 aa  44.3  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26628  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0376  Limonene-12-epoxide hydrolase  27.84 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.378531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3367  hypothetical protein  23.88 
 
 		 130 aa  41.2  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3418  hypothetical protein  23.88 
 
 		 130 aa  41.2  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.451707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3356  hypothetical protein  23.88 
 
 		 130 aa  41.2  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>