16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1469 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1469  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  353  6.999999999999999e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.716507  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1210  ketosteroid isomerase-like protein  67.74 
 
 		 167 aa  191  5e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.187179  normal  0.389634 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5451  hypothetical protein  60.39 
 
 		 165 aa  169  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.454717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1891  hypothetical protein  55.73 
 
 		 140 aa  161  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.239366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3358  ketosteroid isomerase-related protein-like protein  51.52 
 
 		 141 aa  154  4e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0113  ketosteroid isomerase-like protein  51.15 
 
 		 212 aa  153  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4363  ketosteroid isomerase-related protein-like protein  42.52 
 
 		 135 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2898  ketosteroid isomerase-like protein  44.63 
 
 		 153 aa  120  7e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02403  hypothetical protein  33.86 
 
 		 284 aa  79.7  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1640  hypothetical protein  34.04 
 
 		 138 aa  77  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0534707  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3634  protein of unknown function DUF1486  35.04 
 
 		 143 aa  73.6  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1969  hypothetical protein  31.85 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.383459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1317  protein of unknown function DUF1486  36.73 
 
 		 138 aa  42  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26628  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3358  hypothetical protein  26.89 
 
 		 131 aa  40.8  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.8978  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3420  hypothetical protein  26.89 
 
 		 131 aa  40.8  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3369  hypothetical protein  26.89 
 
 		 131 aa  40.8  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.915691  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>