20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6122 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_6122  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  266  5.9999999999999995e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.800704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2428  protein of unknown function DUF1486  33.86 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000117407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4344  hypothetical protein  36.51 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35800  hypothetical protein  34.29 
 
 		 287 aa  67  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2650  protein of unknown function DUF1486  28.57 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.679819 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3231  ketosteroid isomerase-like protein  28.1 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.274911 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3203  hypothetical protein  28.99 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0185892 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4942  hypothetical protein  29.09 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1634  hypothetical protein  30.95 
 
 		 127 aa  51.2  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.347419  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3364  protein of unknown function DUF1486  27.05 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3975  hypothetical protein  28.21 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3764  hypothetical protein  29.75 
 
 		 359 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0186816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1849  hypothetical protein  26.56 
 
 		 250 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4622  hypothetical protein  30.36 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5869  protein of unknown function DUF1486  23.33 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1111  hypothetical protein  24.8 
 
 		 128 aa  41.2  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0681  protein of unknown function DUF1486  30 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5856  protein of unknown function DUF1486  25.83 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1775  hypothetical protein  26.72 
 
 		 146 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3132  hypothetical protein  22.95 
 
 		 139 aa  40  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.584475  normal  0.267195 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>