38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_35800 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_35800  hypothetical protein  100 
 
 
287 aa  561  1.0000000000000001e-159  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1864  hypothetical protein  52.14 
 
 
143 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1815  hypothetical protein  52.14 
 
 
143 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3472  hypothetical protein  52.14 
 
 
147 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2420  hypothetical protein  51.47 
 
 
143 aa  147  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1502  hypothetical protein  50 
 
 
143 aa  144  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.516815  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1510  hypothetical protein  49.26 
 
 
143 aa  143  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4942  hypothetical protein  45.54 
 
 
134 aa  94.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2458  hypothetical protein  36.07 
 
 
149 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.500817  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4688  hypothetical protein  33.83 
 
 
151 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.940005  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4344  hypothetical protein  44.35 
 
 
140 aa  80.1  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2428  protein of unknown function DUF1486  36.61 
 
 
141 aa  79.7  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000117407  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2650  protein of unknown function DUF1486  34.81 
 
 
138 aa  67.4  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.679819 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6122  hypothetical protein  34.29 
 
 
132 aa  67  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.800704  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5171  hypothetical protein  32.73 
 
 
134 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.182508  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0229  hypothetical protein  30.43 
 
 
159 aa  58.9  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3231  ketosteroid isomerase-like protein  29.09 
 
 
134 aa  57.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.274911 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3334  hypothetical protein  31.82 
 
 
134 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1111  hypothetical protein  28.85 
 
 
128 aa  54.7  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1775  hypothetical protein  28.28 
 
 
146 aa  50.8  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263293  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3498  hypothetical protein  26.13 
 
 
138 aa  49.3  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.718505 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3364  protein of unknown function DUF1486  29.09 
 
 
137 aa  48.5  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2954  hypothetical protein  28.57 
 
 
130 aa  48.9  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3203  hypothetical protein  23.47 
 
 
190 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0185892 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2864  hypothetical protein  24.64 
 
 
139 aa  47.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5869  protein of unknown function DUF1486  23.64 
 
 
138 aa  47  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3109  hypothetical protein  28.33 
 
 
132 aa  46.6  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.662337  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1634  hypothetical protein  29.03 
 
 
127 aa  46.2  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.347419  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5173  hypothetical protein  34.67 
 
 
156 aa  45.8  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.0013731  hitchhiker  0.00383993 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4832  hypothetical protein  24.29 
 
 
143 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5856  protein of unknown function DUF1486  24.11 
 
 
137 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7476  Limonene-12-epoxide hydrolase  30.08 
 
 
143 aa  43.5  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0495264  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3764  hypothetical protein  31.58 
 
 
359 aa  43.5  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0186816  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3629  hypothetical protein  30.67 
 
 
141 aa  42.7  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.456472  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5659  putative ketosteroid isomerase-related protein  36.46 
 
 
142 aa  42.7  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5975  hypothetical protein  27.64 
 
 
132 aa  42.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.073965 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4808  limonene-1,2-epoxide hydrolase  27.36 
 
 
130 aa  42.4  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.63698 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1094  hypothetical protein  26.85 
 
 
131 aa  42  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0133355 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>