37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3975 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3975  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  280  5.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289621  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3498  hypothetical protein  41.41 
 
 
138 aa  112  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.718505 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3755  ketosteroid isomerase-like protein  33.87 
 
 
137 aa  75.9  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3764  hypothetical protein  29.17 
 
 
359 aa  64.3  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0186816  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1111  hypothetical protein  29.46 
 
 
128 aa  61.6  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1634  hypothetical protein  29.66 
 
 
127 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.347419  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0206  hypothetical protein  29.13 
 
 
131 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5869  protein of unknown function DUF1486  27.34 
 
 
138 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4808  limonene-1,2-epoxide hydrolase  31.25 
 
 
130 aa  53.9  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.63698 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5171  hypothetical protein  28.8 
 
 
134 aa  52.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.182508  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3334  hypothetical protein  28.8 
 
 
134 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0827  hypothetical protein  25.71 
 
 
145 aa  52  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.348672  unclonable  0.00000936825 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3364  protein of unknown function DUF1486  29.46 
 
 
137 aa  51.2  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4622  hypothetical protein  25 
 
 
136 aa  50.8  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276317  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3231  ketosteroid isomerase-like protein  22.88 
 
 
134 aa  50.4  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.274911 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6122  hypothetical protein  28.21 
 
 
132 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.800704  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0272  putative limonene-1,2-epoxide hydrolase  26.56 
 
 
131 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7525  hypothetical protein  30 
 
 
130 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321809  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2954  hypothetical protein  22.58 
 
 
130 aa  45.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0181  putative limonene-1,2-epoxide hydrolase  25.78 
 
 
131 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1094  hypothetical protein  24.6 
 
 
131 aa  44.3  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3367  hypothetical protein  25.58 
 
 
130 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3418  hypothetical protein  25.58 
 
 
130 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.451707  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3356  hypothetical protein  25.58 
 
 
130 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2785  ketosteroid isomerase-like protein  28.09 
 
 
165 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00716853  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0063  hypothetical protein  26.23 
 
 
158 aa  42.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0367  Hemolysin-type calcium-binding region  30.67 
 
 
726 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0736  hypothetical protein  20.93 
 
 
133 aa  40.8  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000116792  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3420  hypothetical protein  25.41 
 
 
131 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326133  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5856  protein of unknown function DUF1486  22.48 
 
 
137 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1645  limonene-1,2-epoxide hydrolase catalytic domain-contain protein  27.21 
 
 
1420 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3109  hypothetical protein  22.31 
 
 
132 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.662337  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3358  hypothetical protein  25.41 
 
 
131 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.8978  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3369  hypothetical protein  25.41 
 
 
131 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.915691  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1204  ketosteroid isomerase-related protein  26.14 
 
 
156 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0307443  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4942  hypothetical protein  27.59 
 
 
134 aa  40  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3167  hypothetical protein  26.14 
 
 
156 aa  40  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.169208  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>