36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1645 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1645  limonene-1,2-epoxide hydrolase catalytic domain-contain protein  100 
 
 
1420 aa  2556    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0272  putative limonene-1,2-epoxide hydrolase  100 
 
 
131 aa  282  3e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0181  putative limonene-1,2-epoxide hydrolase  99.24 
 
 
131 aa  279  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0206  hypothetical protein  94.66 
 
 
131 aa  267  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7525  hypothetical protein  40.16 
 
 
130 aa  84.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321809  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2954  hypothetical protein  36.51 
 
 
130 aa  79  0.0000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3334  hypothetical protein  35.25 
 
 
134 aa  62.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5171  hypothetical protein  35.25 
 
 
134 aa  62.4  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.182508  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3764  hypothetical protein  29.6 
 
 
359 aa  62  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0186816  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0063  hypothetical protein  34.48 
 
 
158 aa  60.1  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4449  hypothetical protein  33.85 
 
 
129 aa  58.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.904253  normal  0.0764315 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1111  hypothetical protein  33.33 
 
 
128 aa  53.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3364  protein of unknown function DUF1486  30.23 
 
 
137 aa  50.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2225  hypothetical protein  30 
 
 
131 aa  50.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134673 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0736  hypothetical protein  28 
 
 
133 aa  50.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000116792  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3231  ketosteroid isomerase-like protein  24.03 
 
 
134 aa  49.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.274911 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5869  protein of unknown function DUF1486  27.2 
 
 
138 aa  49.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3310  hypothetical protein  28.24 
 
 
156 aa  47.8  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0294644 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0917  hypothetical protein  27.42 
 
 
133 aa  48.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000348146  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0273  hypothetical protein  30.22 
 
 
139 aa  48.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.739409  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0059  hypothetical protein  30.23 
 
 
130 aa  48.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3358  hypothetical protein  31.25 
 
 
131 aa  48.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.8978  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3420  hypothetical protein  31.25 
 
 
131 aa  48.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326133  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3369  hypothetical protein  31.25 
 
 
131 aa  48.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.915691  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0058  hypothetical protein  30.23 
 
 
130 aa  48.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.118011  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2716  hypothetical protein  29.63 
 
 
130 aa  47.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374987  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3291  hypothetical protein  29.63 
 
 
130 aa  47.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.932341  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0723  hypothetical protein  27.2 
 
 
140 aa  47  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000344598  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1836  hypothetical protein  29.63 
 
 
130 aa  47.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4808  limonene-1,2-epoxide hydrolase  32.11 
 
 
130 aa  46.6  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.63698 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3166  hypothetical protein  28.24 
 
 
156 aa  47  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.55884  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0737  hypothetical protein  26.19 
 
 
134 aa  46.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00542043  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4245  hypothetical protein  24.38 
 
 
176 aa  46.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.13713 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1634  hypothetical protein  32.54 
 
 
127 aa  45.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.347419  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0991  hypothetical protein  26.4 
 
 
133 aa  45.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00914554  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0880  hypothetical protein  26.19 
 
 
133 aa  45.1  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>