54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5171 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_5171  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  275  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.182508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3334  hypothetical protein  98.51 
 
 		 134 aa  272  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1111  hypothetical protein  43.7 
 
 		 128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1094  hypothetical protein  42.42 
 
 		 131 aa  97.8  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5869  protein of unknown function DUF1486  39.69 
 
 		 138 aa  97.1  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3364  protein of unknown function DUF1486  37.31 
 
 		 137 aa  93.2  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3231  ketosteroid isomerase-like protein  32.56 
 
 		 134 aa  84.7  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.274911 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3764  hypothetical protein  38.52 
 
 		 359 aa  84.3  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0186816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5856  protein of unknown function DUF1486  35.88 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3755  ketosteroid isomerase-like protein  34.38 
 
 		 137 aa  81.3  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0206  hypothetical protein  37.4 
 
 		 131 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4942  hypothetical protein  36.61 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1634  hypothetical protein  33.33 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.347419  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0272  putative limonene-1,2-epoxide hydrolase  34.96 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0181  putative limonene-1,2-epoxide hydrolase  34.96 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1645  limonene-1,2-epoxide hydrolase catalytic domain-contain protein  35.25 
 
 		 1420 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35800  hypothetical protein  32.73 
 
 		 287 aa  68.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4622  hypothetical protein  31.82 
 
 		 136 aa  67  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3498  hypothetical protein  30.95 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718505 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3975  hypothetical protein  28.8 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2954  hypothetical protein  31.71 
 
 		 130 aa  62  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4808  limonene-1,2-epoxide hydrolase  33.63 
 
 		 130 aa  62  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.63698 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9084  hypothetical protein  35 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1696  hypothetical protein  30.47 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.661261  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3132  hypothetical protein  27.21 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.584475  normal  0.267195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7525  hypothetical protein  30.65 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321809  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41030  hypothetical protein  31.45 
 
 		 129 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1777  hypothetical protein  28 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3367  hypothetical protein  31.54 
 
 		 130 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3418  hypothetical protein  31.54 
 
 		 130 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.451707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3356  hypothetical protein  31.54 
 
 		 130 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2428  protein of unknown function DUF1486  26.23 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000117407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0827  hypothetical protein  27.05 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.348672  unclonable  0.00000936825 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10033  hypothetical protein  23.58 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.505425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1317  protein of unknown function DUF1486  25.53 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26628  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3109  hypothetical protein  25.95 
 
 		 132 aa  45.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.662337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0880  hypothetical protein  24.8 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0737  hypothetical protein  24.22 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00542043  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4449  hypothetical protein  25.95 
 
 		 129 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.904253  normal  0.0764315 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4455  hypothetical protein  24.03 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00728283  normal  0.540789 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2650  protein of unknown function DUF1486  27.93 
 
 		 138 aa  44.3  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.679819 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0063  hypothetical protein  30.83 
 
 		 158 aa  43.9  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0917  hypothetical protein  24.8 
 
 		 133 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000348146  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3369  hypothetical protein  29.13 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.915691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3420  hypothetical protein  29.13 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3358  hypothetical protein  29.13 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.8978  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6122  hypothetical protein  25.2 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.800704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0991  hypothetical protein  25.6 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00914554  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0736  hypothetical protein  23.2 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000116792  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1204  ketosteroid isomerase-related protein  26.83 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0307443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0922  hypothetical protein  24.8 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.56602e-43 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3167  hypothetical protein  26.83 
 
 		 156 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.169208  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4019  hypothetical protein  26.02 
 
 		 142 aa  40.4  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4379  hypothetical protein  25.62 
 
 		 130 aa  40  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.73238e-23 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>