19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9084 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_9084  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  267  4e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0728  hypothetical protein  40.65 
 
 
130 aa  94  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2092  hypothetical protein  34.96 
 
 
130 aa  80.1  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.390718  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3629  hypothetical protein  33.86 
 
 
141 aa  74.3  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.456472  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5659  putative ketosteroid isomerase-related protein  32.23 
 
 
142 aa  72  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1451  hypothetical protein  28.12 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0822  hypothetical protein  28.57 
 
 
135 aa  65.1  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10033  hypothetical protein  29.01 
 
 
131 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.505425  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2116  protein of unknown function DUF1486  28.35 
 
 
129 aa  56.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5171  hypothetical protein  34.17 
 
 
134 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.182508  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3334  hypothetical protein  32.5 
 
 
134 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2155  putative ketosteroid isomerase-related protein  32.74 
 
 
138 aa  49.7  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.882002  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1111  hypothetical protein  30.7 
 
 
128 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0206  hypothetical protein  33.96 
 
 
131 aa  44.3  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3420  hypothetical protein  35.94 
 
 
131 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326133  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3369  hypothetical protein  35.94 
 
 
131 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.915691  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3498  hypothetical protein  26.83 
 
 
138 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.718505 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3358  hypothetical protein  35.94 
 
 
131 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.8978  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1094  hypothetical protein  28.33 
 
 
131 aa  41.2  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0133355 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>