24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1451 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1451  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  279  8.000000000000001e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0822  hypothetical protein  99.26 
 
 
135 aa  278  3e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2116  protein of unknown function DUF1486  39.68 
 
 
129 aa  94  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1102  hypothetical protein  34.43 
 
 
132 aa  74.7  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9084  hypothetical protein  28.12 
 
 
131 aa  68.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0728  hypothetical protein  32.52 
 
 
130 aa  67.8  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3358  hypothetical protein  45.76 
 
 
131 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.8978  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3420  hypothetical protein  45.76 
 
 
131 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326133  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3369  hypothetical protein  45.76 
 
 
131 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.915691  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3356  hypothetical protein  31.36 
 
 
130 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3418  hypothetical protein  31.36 
 
 
130 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.451707  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3367  hypothetical protein  31.36 
 
 
130 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2092  hypothetical protein  27.87 
 
 
130 aa  58.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.390718  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5659  putative ketosteroid isomerase-related protein  28.33 
 
 
142 aa  57  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3629  hypothetical protein  25.93 
 
 
141 aa  54.3  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.456472  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10033  hypothetical protein  24.41 
 
 
131 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.505425  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0604  esterase/lipase-like protein  26.27 
 
 
407 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163166  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2618  protein of unknown function DUF1486  26.55 
 
 
110 aa  47  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1448  nuclear transport factor 2  24.35 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0272  putative limonene-1,2-epoxide hydrolase  26.55 
 
 
131 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1645  limonene-1,2-epoxide hydrolase catalytic domain-contain protein  26.55 
 
 
1420 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2954  hypothetical protein  26.13 
 
 
130 aa  40.8  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0181  putative limonene-1,2-epoxide hydrolase  25.66 
 
 
131 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3364  protein of unknown function DUF1486  36.84 
 
 
137 aa  40.4  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>