14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1102 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1102  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  272  1.0000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2116  protein of unknown function DUF1486  37.1 
 
 		 129 aa  90.1  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1451  hypothetical protein  34.43 
 
 		 135 aa  67  0.00000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0822  hypothetical protein  33.61 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0728  hypothetical protein  26.15 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3358  hypothetical protein  27.82 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.8978  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3420  hypothetical protein  27.82 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3369  hypothetical protein  27.82 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.915691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2092  hypothetical protein  26.72 
 
 		 130 aa  42.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.390718  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3356  hypothetical protein  24.6 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3418  hypothetical protein  24.6 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.451707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3367  hypothetical protein  24.6 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10033  hypothetical protein  22.58 
 
 		 131 aa  40.4  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.505425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0376  Limonene-12-epoxide hydrolase  25.42 
 
 		 137 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.378531  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>