17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0728 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0728  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  260  4.999999999999999e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2092  hypothetical protein  75.97 
 
 
130 aa  211  2.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.390718  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9084  hypothetical protein  40.65 
 
 
131 aa  94  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10033  hypothetical protein  34.96 
 
 
131 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.505425  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5659  putative ketosteroid isomerase-related protein  33.33 
 
 
142 aa  73.9  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3629  hypothetical protein  38.4 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.456472  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1451  hypothetical protein  32.52 
 
 
135 aa  64.3  0.0000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0822  hypothetical protein  31.71 
 
 
135 aa  62  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2116  protein of unknown function DUF1486  32.17 
 
 
129 aa  61.2  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1102  hypothetical protein  26.15 
 
 
132 aa  48.5  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3369  hypothetical protein  33.33 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.915691  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3420  hypothetical protein  33.33 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326133  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3358  hypothetical protein  33.33 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.8978  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2606  hypothetical protein  30.26 
 
 
228 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000194821  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3367  hypothetical protein  32.43 
 
 
130 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3418  hypothetical protein  32.43 
 
 
130 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.451707  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3356  hypothetical protein  32.43 
 
 
130 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>