12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2092 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2092  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  265  1e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.390718  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0728  hypothetical protein  75.97 
 
 
130 aa  211  2.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5659  putative ketosteroid isomerase-related protein  36.72 
 
 
142 aa  82  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9084  hypothetical protein  34.96 
 
 
131 aa  80.1  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10033  hypothetical protein  34.15 
 
 
131 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.505425  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3629  hypothetical protein  34.4 
 
 
141 aa  61.6  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.456472  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1451  hypothetical protein  27.87 
 
 
135 aa  58.9  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0822  hypothetical protein  27.05 
 
 
135 aa  56.6  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2116  protein of unknown function DUF1486  28.33 
 
 
129 aa  56.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2606  hypothetical protein  29.9 
 
 
228 aa  48.9  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000194821  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4468  hypothetical protein  28.46 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1102  hypothetical protein  26.72 
 
 
132 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>