16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5659 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5659  putative ketosteroid isomerase-related protein  100 
 
 
142 aa  286  5.0000000000000004e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2092  hypothetical protein  36.72 
 
 
130 aa  82  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.390718  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0728  hypothetical protein  33.33 
 
 
130 aa  73.9  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9084  hypothetical protein  32.23 
 
 
131 aa  72  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3629  hypothetical protein  38.28 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.456472  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1451  hypothetical protein  29.41 
 
 
135 aa  52  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0822  hypothetical protein  28.57 
 
 
135 aa  49.7  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2116  protein of unknown function DUF1486  28.69 
 
 
129 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2155  putative ketosteroid isomerase-related protein  33.04 
 
 
138 aa  47.8  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.882002  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10033  hypothetical protein  29.41 
 
 
131 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.505425  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3358  hypothetical protein  28.03 
 
 
131 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.8978  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3420  hypothetical protein  28.03 
 
 
131 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326133  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3369  hypothetical protein  28.03 
 
 
131 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.915691  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35800  hypothetical protein  36.46 
 
 
287 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2215  S-adenosylmethionine--tRNA-ribosyltransferase- isomerase  35.62 
 
 
351 aa  42  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0141538  normal  0.152842 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0518  glycosyl transferase family protein  31.37 
 
 
341 aa  40.4  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>