20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0501 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0501  hypothetical protein  100 
 
 		 117 aa  242  9.999999999999999e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.89732  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0662  hypothetical protein  100 
 
 		 117 aa  242  9.999999999999999e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0119  hypothetical protein  64.1 
 
 		 119 aa  164  2.9999999999999998e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0226  hypothetical protein  56.03 
 
 		 121 aa  150  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1929  hypothetical protein  57.76 
 
 		 121 aa  150  7e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0943  hypothetical protein  57.76 
 
 		 121 aa  150  7e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1231  hypothetical protein  57.76 
 
 		 121 aa  150  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.999347  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0312  hypothetical protein  57.76 
 
 		 121 aa  150  7e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2206  hypothetical protein  57.76 
 
 		 121 aa  150  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0222  hypothetical protein  56.9 
 
 		 121 aa  149  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.958256  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1675  hypothetical protein  56.9 
 
 		 171 aa  148  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.616326  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0187  hypothetical protein  38.89 
 
 		 114 aa  93.6  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2614  hypothetical protein  36.94 
 
 		 117 aa  86.7  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4101  hypothetical protein  37.04 
 
 		 122 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0751717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4024  hypothetical protein  42.99 
 
 		 118 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000625612  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4124  hypothetical protein  33.62 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1549  hypothetical protein  35.51 
 
 		 217 aa  63.9  0.0000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.245035  normal  0.421629 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1443  hypothetical protein  41.46 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0357  hypothetical protein  34 
 
 		 62 aa  51.6  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6918  hypothetical protein  22.95 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.777422 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>