25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0187 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0187  hypothetical protein  100 
 
 
114 aa  243  8e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255272  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2614  hypothetical protein  50.93 
 
 
117 aa  115  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0119  hypothetical protein  41.82 
 
 
119 aa  105  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0226  hypothetical protein  41.07 
 
 
121 aa  101  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0662  hypothetical protein  38.89 
 
 
117 aa  93.6  9e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0501  hypothetical protein  38.89 
 
 
117 aa  93.6  9e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.89732  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0312  hypothetical protein  38.74 
 
 
121 aa  90.5  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0222  hypothetical protein  37.84 
 
 
121 aa  90.1  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.958256  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1929  hypothetical protein  37.84 
 
 
121 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2206  hypothetical protein  37.84 
 
 
121 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1231  hypothetical protein  37.84 
 
 
121 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.999347  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0943  hypothetical protein  37.84 
 
 
121 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1675  hypothetical protein  38.53 
 
 
171 aa  87.8  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.616326  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4101  hypothetical protein  35.14 
 
 
122 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0751717  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1549  hypothetical protein  39.6 
 
 
217 aa  73.9  0.0000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.245035  normal  0.421629 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1443  hypothetical protein  45.24 
 
 
125 aa  71.6  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4024  hypothetical protein  33.66 
 
 
118 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000625612  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4124  hypothetical protein  30.7 
 
 
124 aa  60.1  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6918  hypothetical protein  27.68 
 
 
135 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.777422 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2946  hypothetical protein  38.33 
 
 
150 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3072  hypothetical protein  38.33 
 
 
204 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.409744  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1299  hypothetical protein  36.51 
 
 
243 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0357  hypothetical protein  36.17 
 
 
62 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2267  hypothetical protein  27.06 
 
 
123 aa  41.6  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.482211  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0368  hypothetical protein  27.4 
 
 
123 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>