25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A2946 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1299  hypothetical protein  100 
 
 
243 aa  308  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3072  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  307  4e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.409744  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2946  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  305  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4882  hypothetical protein  43.7 
 
 
143 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116693  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5302  hypothetical protein  44.53 
 
 
146 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0891883  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5558  hypothetical protein  44.53 
 
 
146 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5430  hypothetical protein  44.44 
 
 
143 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3248  hypothetical protein  46.48 
 
 
145 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.330026 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4714  hypothetical protein  44.53 
 
 
146 aa  110  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0275  hypothetical protein  43.31 
 
 
153 aa  108  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0101  hypothetical protein  45.19 
 
 
149 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1561  hypothetical protein  43.09 
 
 
140 aa  105  3e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.121168  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0187  hypothetical protein  38.33 
 
 
114 aa  53.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255272  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1421  hypothetical protein  26.96 
 
 
125 aa  45.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0226  hypothetical protein  34.33 
 
 
121 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0119  hypothetical protein  30.16 
 
 
119 aa  44.3  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2267  hypothetical protein  33.93 
 
 
123 aa  41.6  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.482211  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2206  hypothetical protein  33.93 
 
 
121 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1231  hypothetical protein  33.93 
 
 
121 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.999347  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0943  hypothetical protein  33.93 
 
 
121 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1929  hypothetical protein  33.93 
 
 
121 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4269  hypothetical protein  25.9 
 
 
146 aa  40.8  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13101  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1443  hypothetical protein  34.62 
 
 
125 aa  40.8  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0222  hypothetical protein  33.93 
 
 
121 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.958256  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0312  hypothetical protein  33.93 
 
 
121 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>