13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1561 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1561  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  291  3e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.121168  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0101  hypothetical protein  48.09 
 
 
149 aa  136  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4882  hypothetical protein  42.31 
 
 
143 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116693  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5302  hypothetical protein  50.41 
 
 
146 aa  129  9e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0891883  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5558  hypothetical protein  50.41 
 
 
146 aa  129  9e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0275  hypothetical protein  40.31 
 
 
153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4714  hypothetical protein  49.59 
 
 
146 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5430  hypothetical protein  43.08 
 
 
143 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3248  hypothetical protein  46.72 
 
 
145 aa  121  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.330026 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3072  hypothetical protein  43.09 
 
 
204 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.409744  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1299  hypothetical protein  43.09 
 
 
243 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2946  hypothetical protein  43.09 
 
 
150 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4101  hypothetical protein  30.43 
 
 
122 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0751717  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>