24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5430 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5430  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  290  5e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4882  hypothetical protein  97.2 
 
 		 143 aa  284  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116693  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5302  hypothetical protein  83.1 
 
 		 146 aa  219  8e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0891883  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5558  hypothetical protein  83.1 
 
 		 146 aa  219  8e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4714  hypothetical protein  83.1 
 
 		 146 aa  218  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0101  hypothetical protein  78.87 
 
 		 149 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3248  hypothetical protein  85.19 
 
 		 145 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.330026 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0275  hypothetical protein  50.76 
 
 		 153 aa  144  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1561  hypothetical protein  43.08 
 
 		 140 aa  138  1.9999999999999998e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.121168  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1299  hypothetical protein  45.19 
 
 		 243 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3072  hypothetical protein  45.19 
 
 		 204 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.409744  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2946  hypothetical protein  45.19 
 
 		 150 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0569  phenazine biosynthesis protein  32.5 
 
 		 141 aa  47.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0226  hypothetical protein  40.32 
 
 		 121 aa  44.7  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2431  hypothetical protein  29.6 
 
 		 239 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0800028  normal  0.133087 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2206  hypothetical protein  38.71 
 
 		 121 aa  41.2  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1231  hypothetical protein  38.71 
 
 		 121 aa  41.2  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.999347  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0943  hypothetical protein  38.71 
 
 		 121 aa  41.2  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1929  hypothetical protein  38.71 
 
 		 121 aa  41.2  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0222  hypothetical protein  38.71 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.958256  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0312  hypothetical protein  38.71 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1675  hypothetical protein  38.71 
 
 		 171 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.616326  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0187  hypothetical protein  39.29 
 
 		 114 aa  40.4  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3910  hypothetical protein  47.22 
 
 		 170 aa  40.4  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.257204  normal  0.0784799 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>