22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2431 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2431  hypothetical protein  100 
 
 
239 aa  486  1e-136  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0800028  normal  0.133087 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1913  hypothetical protein  52.83 
 
 
119 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0466673  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0429  hypothetical protein  46.61 
 
 
124 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4155  hypothetical protein  54.21 
 
 
122 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.399462 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1637  cupin 2 domain-containing protein  49.02 
 
 
137 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.316087  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0528  hypothetical protein  45.54 
 
 
124 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0331265  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6212  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.63 
 
 
121 aa  102  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0947476  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1574  hypothetical protein  47 
 
 
120 aa  99  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0500  hypothetical protein  43.56 
 
 
126 aa  97.8  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2852  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.35 
 
 
126 aa  97.4  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2641  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.66 
 
 
123 aa  96.7  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.17261 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1290  hypothetical protein  42.86 
 
 
119 aa  96.3  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00531364  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1363  cupin 2 domain-containing protein  46.08 
 
 
118 aa  95.5  7e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3001  hypothetical protein  42.86 
 
 
122 aa  95.1  9e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00623326  decreased coverage  0.0000358597 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3702  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.56 
 
 
120 aa  94.7  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2282  hypothetical protein  37.74 
 
 
132 aa  90.5  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00820926  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3019  hypothetical protein  41.75 
 
 
124 aa  87.4  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.122791 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2333  hypothetical protein  38.3 
 
 
125 aa  83.2  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607058  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3430  hypothetical protein  39.58 
 
 
122 aa  76.3  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2480  hypothetical protein  40.2 
 
 
125 aa  75.9  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.289333 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_18632  predicted protein  27.27 
 
 
267 aa  52.4  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  unclonable  0.000481195 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4882  hypothetical protein  29.6 
 
 
143 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116693  normal  0.210871 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>