16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4882 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4882  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  290  4e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116693  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5430  hypothetical protein  97.2 
 
 		 143 aa  264  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5302  hypothetical protein  81.69 
 
 		 146 aa  217  5e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0891883  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5558  hypothetical protein  81.69 
 
 		 146 aa  217  5e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4714  hypothetical protein  81.69 
 
 		 146 aa  214  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0101  hypothetical protein  77.46 
 
 		 149 aa  209  7e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3248  hypothetical protein  83.7 
 
 		 145 aa  207  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.330026 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0275  hypothetical protein  52 
 
 		 153 aa  143  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1561  hypothetical protein  42.31 
 
 		 140 aa  136  1e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.121168  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1299  hypothetical protein  43.7 
 
 		 243 aa  114  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3072  hypothetical protein  43.7 
 
 		 204 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.409744  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2946  hypothetical protein  43.7 
 
 		 150 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0569  phenazine biosynthesis protein  34.17 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2431  hypothetical protein  29.6 
 
 		 239 aa  44.3  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0800028  normal  0.133087 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0226  hypothetical protein  38.71 
 
 		 121 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3910  hypothetical protein  33.33 
 
 		 170 aa  40.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.257204  normal  0.0784799 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>