20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2614 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2614  hypothetical protein  100 
 
 
117 aa  245  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0187  hypothetical protein  50.93 
 
 
114 aa  115  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255272  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0226  hypothetical protein  40.17 
 
 
121 aa  95.5  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0312  hypothetical protein  39.32 
 
 
121 aa  93.6  8e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0222  hypothetical protein  38.46 
 
 
121 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.958256  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0119  hypothetical protein  40.37 
 
 
119 aa  92.4  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1675  hypothetical protein  38.46 
 
 
171 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.616326  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0943  hypothetical protein  38.46 
 
 
121 aa  90.9  6e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1231  hypothetical protein  38.46 
 
 
121 aa  90.9  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.999347  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1929  hypothetical protein  38.46 
 
 
121 aa  90.9  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2206  hypothetical protein  38.46 
 
 
121 aa  90.9  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0662  hypothetical protein  36.94 
 
 
117 aa  86.7  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0501  hypothetical protein  36.94 
 
 
117 aa  86.7  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.89732  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4101  hypothetical protein  35.92 
 
 
122 aa  84  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0751717  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4124  hypothetical protein  38.39 
 
 
124 aa  80.5  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4024  hypothetical protein  29.73 
 
 
118 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000625612  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1549  hypothetical protein  33.64 
 
 
217 aa  56.6  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.245035  normal  0.421629 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1443  hypothetical protein  34.44 
 
 
125 aa  53.9  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6918  hypothetical protein  22.94 
 
 
135 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.777422 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1644  hypothetical protein  31.4 
 
 
139 aa  40.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.25271  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>