26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3751 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3751  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  275  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.576288  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2020  hypothetical protein  74.22 
 
 		 132 aa  202  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4728  hypothetical protein  62.4 
 
 		 134 aa  167  6e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.467083  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3849  protein of unknown function DUF1486  57.72 
 
 		 140 aa  145  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6225  hypothetical protein  57.02 
 
 		 133 aa  141  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4362  protein of unknown function DUF1486  55.83 
 
 		 136 aa  140  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.364126 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0684  putative taurine dehydrogenase, small subunit  56.67 
 
 		 136 aa  140  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1992  hypothetical protein  54.69 
 
 		 132 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.209953  normal  0.907507 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4515  hypothetical protein  58.04 
 
 		 134 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.275606 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3504  hypothetical protein  53.57 
 
 		 129 aa  126  8.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501161  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4862  hypothetical protein  52.94 
 
 		 128 aa  125  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711922  normal  0.253154 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3154  hypothetical protein  48.72 
 
 		 120 aa  121  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.34037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1830  hypothetical protein  49.6 
 
 		 128 aa  120  7e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.126678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2636  protein of unknown function DUF1486  52.21 
 
 		 128 aa  117  7.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000287228  hitchhiker  0.00453298 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4013  hypothetical protein  45.67 
 
 		 131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.772114  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0117  protein of unknown function DUF1486  49.59 
 
 		 135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1644  hypothetical protein  48.28 
 
 		 139 aa  108  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.25271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0138  hypothetical protein  45.83 
 
 		 144 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0652992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4758  hypothetical protein  41.41 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1421  hypothetical protein  30.97 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0723  hypothetical protein  30.91 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00486014 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4546  hypothetical protein  28.81 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00100705  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1595  hypothetical protein  22.95 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000510897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1031  hypothetical protein  32.08 
 
 		 149 aa  40.4  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.95008  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4124  hypothetical protein  27.18 
 
 		 124 aa  40.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1024  limonene-1,2-epoxide hydrolase  30.19 
 
 		 119 aa  40  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.903777  normal  0.0576424 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>