11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4546 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4546  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  270  6e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00100705  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1514  steroid delta-isomerase  33.85 
 
 		 126 aa  47  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4013  hypothetical protein  29.17 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.772114  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1830  hypothetical protein  31.25 
 
 		 128 aa  43.9  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.126678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4728  hypothetical protein  27.73 
 
 		 134 aa  43.5  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.467083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3751  hypothetical protein  28.81 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.576288  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3504  hypothetical protein  30.36 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501161  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4758  hypothetical protein  27.78 
 
 		 132 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1644  hypothetical protein  28.95 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.25271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3849  protein of unknown function DUF1486  27.35 
 
 		 140 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6225  hypothetical protein  28.1 
 
 		 133 aa  40.8  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>