22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0117 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0117  protein of unknown function DUF1486  100 
 
 		 135 aa  274  3e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0138  hypothetical protein  82.09 
 
 		 144 aa  229  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0652992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4758  hypothetical protein  56.1 
 
 		 132 aa  140  8e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4362  protein of unknown function DUF1486  58.97 
 
 		 136 aa  135  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.364126 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0684  putative taurine dehydrogenase, small subunit  59.48 
 
 		 136 aa  135  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1992  hypothetical protein  57.98 
 
 		 132 aa  133  8e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.209953  normal  0.907507 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4862  hypothetical protein  53.72 
 
 		 128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711922  normal  0.253154 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4515  hypothetical protein  59.29 
 
 		 134 aa  131  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.275606 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6225  hypothetical protein  56.9 
 
 		 133 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3849  protein of unknown function DUF1486  53.33 
 
 		 140 aa  127  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4728  hypothetical protein  48.28 
 
 		 134 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.467083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3504  hypothetical protein  49.17 
 
 		 129 aa  117  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501161  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2020  hypothetical protein  46.4 
 
 		 132 aa  110  9e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3751  hypothetical protein  49.59 
 
 		 134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.576288  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1830  hypothetical protein  47.01 
 
 		 128 aa  106  8.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.126678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2636  protein of unknown function DUF1486  47.75 
 
 		 128 aa  105  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000287228  hitchhiker  0.00453298 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4013  hypothetical protein  47.5 
 
 		 131 aa  104  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.772114  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1644  hypothetical protein  47.41 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.25271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3154  hypothetical protein  45.61 
 
 		 120 aa  98.2  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.34037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3605  hypothetical protein  28 
 
 		 128 aa  44.3  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1421  hypothetical protein  29.91 
 
 		 125 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1179  protein of unknown function DUF1486  46.67 
 
 		 153 aa  40.4  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>