26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4758 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4758  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  263  8e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0117  protein of unknown function DUF1486  56.1 
 
 
135 aa  140  8e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0138  hypothetical protein  57.38 
 
 
144 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0652992  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1992  hypothetical protein  52.31 
 
 
132 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.209953  normal  0.907507 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4515  hypothetical protein  55.86 
 
 
134 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.275606 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6225  hypothetical protein  55.86 
 
 
133 aa  124  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4862  hypothetical protein  51.72 
 
 
128 aa  124  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711922  normal  0.253154 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3504  hypothetical protein  52.07 
 
 
129 aa  124  6e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501161  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0684  putative taurine dehydrogenase, small subunit  54.87 
 
 
136 aa  123  9e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4362  protein of unknown function DUF1486  53.98 
 
 
136 aa  122  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.364126 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1830  hypothetical protein  49.57 
 
 
128 aa  111  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.126678  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3849  protein of unknown function DUF1486  48.62 
 
 
140 aa  110  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4728  hypothetical protein  45.31 
 
 
134 aa  110  8.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.467083  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4013  hypothetical protein  48.72 
 
 
131 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.772114  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1644  hypothetical protein  47.46 
 
 
139 aa  102  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.25271  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3751  hypothetical protein  41.41 
 
 
134 aa  102  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.576288  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3154  hypothetical protein  39.47 
 
 
120 aa  99.8  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.34037  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2636  protein of unknown function DUF1486  49.55 
 
 
128 aa  97.4  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000287228  hitchhiker  0.00453298 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2020  hypothetical protein  42.4 
 
 
132 aa  95.5  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1421  hypothetical protein  32.14 
 
 
125 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1405  protein of unknown function DUF1486  30 
 
 
135 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1078  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 
402 aa  44.3  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.123154  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4546  hypothetical protein  27.78 
 
 
132 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00100705  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2083  steroid delta-isomerase domain-containing protein  27 
 
 
111 aa  41.2  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2282  hypothetical protein  24.41 
 
 
144 aa  40.8  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.182969  normal  0.14017 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1598  hypothetical protein  31.4 
 
 
114 aa  40.4  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.075699 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>