28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1830 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1830  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  263  8e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.126678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4862  hypothetical protein  75.83 
 
 		 128 aa  189  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711922  normal  0.253154 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3504  hypothetical protein  70.16 
 
 		 129 aa  186  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501161  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4013  hypothetical protein  62.31 
 
 		 131 aa  170  5e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.772114  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1644  hypothetical protein  62.4 
 
 		 139 aa  164  2.9999999999999998e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.25271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4728  hypothetical protein  51.2 
 
 		 134 aa  138  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.467083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6225  hypothetical protein  52.07 
 
 		 133 aa  134  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4362  protein of unknown function DUF1486  53.33 
 
 		 136 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.364126 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1992  hypothetical protein  50 
 
 		 132 aa  130  9e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.209953  normal  0.907507 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0684  putative taurine dehydrogenase, small subunit  51.67 
 
 		 136 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3849  protein of unknown function DUF1486  49.59 
 
 		 140 aa  126  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4515  hypothetical protein  52.73 
 
 		 134 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.275606 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2020  hypothetical protein  48.82 
 
 		 132 aa  122  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2636  protein of unknown function DUF1486  54.87 
 
 		 128 aa  121  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000287228  hitchhiker  0.00453298 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3751  hypothetical protein  49.6 
 
 		 134 aa  120  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.576288  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4758  hypothetical protein  49.57 
 
 		 132 aa  111  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0138  hypothetical protein  45.97 
 
 		 144 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0652992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3154  hypothetical protein  43.7 
 
 		 120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.34037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0117  protein of unknown function DUF1486  47.01 
 
 		 135 aa  106  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0937  hypothetical protein  24.79 
 
 		 145 aa  47  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.753125  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4443  hypothetical protein  25.22 
 
 		 132 aa  44.3  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.253642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1039  protein of unknown function DUF1486  27.68 
 
 		 144 aa  44.3  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0723  hypothetical protein  27.35 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00486014 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4546  hypothetical protein  31.25 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00100705  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5586  protein of unknown function DUF1486  30.69 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1031  hypothetical protein  30.77 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.95008  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1179  protein of unknown function DUF1486  29.31 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3605  hypothetical protein  30 
 
 		 128 aa  40.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125588  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>