32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3849 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3849  protein of unknown function DUF1486  100 
 
 		 140 aa  287  4e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4728  hypothetical protein  62.81 
 
 		 134 aa  173  9e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.467083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2020  hypothetical protein  55.73 
 
 		 132 aa  154  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0684  putative taurine dehydrogenase, small subunit  54.81 
 
 		 136 aa  153  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4362  protein of unknown function DUF1486  54.07 
 
 		 136 aa  152  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.364126 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1992  hypothetical protein  59.68 
 
 		 132 aa  152  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.209953  normal  0.907507 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3751  hypothetical protein  56.06 
 
 		 134 aa  150  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.576288  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6225  hypothetical protein  55.3 
 
 		 133 aa  148  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4515  hypothetical protein  60.34 
 
 		 134 aa  147  6e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.275606 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4862  hypothetical protein  55.83 
 
 		 128 aa  145  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711922  normal  0.253154 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2636  protein of unknown function DUF1486  54.78 
 
 		 128 aa  134  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000287228  hitchhiker  0.00453298 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3504  hypothetical protein  49.22 
 
 		 129 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501161  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3154  hypothetical protein  47.86 
 
 		 120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.34037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0117  protein of unknown function DUF1486  53.33 
 
 		 135 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0138  hypothetical protein  50.39 
 
 		 144 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0652992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1830  hypothetical protein  48 
 
 		 128 aa  127  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.126678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4013  hypothetical protein  47.29 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.772114  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4758  hypothetical protein  48.62 
 
 		 132 aa  111  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1644  hypothetical protein  44.83 
 
 		 139 aa  101  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.25271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1421  hypothetical protein  31.58 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0723  hypothetical protein  32.76 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00486014 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1179  protein of unknown function DUF1486  26.23 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1405  protein of unknown function DUF1486  28.43 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1598  hypothetical protein  32.65 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.075699 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1024  limonene-1,2-epoxide hydrolase  31 
 
 		 119 aa  45.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.903777  normal  0.0576424 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1595  hypothetical protein  24.37 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000510897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5664  protein of unknown function DUF1486  24.79 
 
 		 257 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2015  hypothetical protein  29.23 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2040  hypothetical protein  29.23 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00000602687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13800  hypothetical protein  26.19 
 
 		 119 aa  40.4  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.31421 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3605  hypothetical protein  28.7 
 
 		 128 aa  40.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4546  hypothetical protein  27.35 
 
 		 132 aa  40  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00100705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>