30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4362 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4362  protein of unknown function DUF1486  100 
 
 
136 aa  280  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.364126 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0684  putative taurine dehydrogenase, small subunit  95.59 
 
 
136 aa  270  6e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6225  hypothetical protein  89.34 
 
 
133 aa  231  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1992  hypothetical protein  87.12 
 
 
132 aa  231  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.209953  normal  0.907507 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4515  hypothetical protein  92.11 
 
 
134 aa  220  6e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.275606 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4728  hypothetical protein  58.73 
 
 
134 aa  165  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.467083  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3849  protein of unknown function DUF1486  58.54 
 
 
140 aa  148  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4862  hypothetical protein  58.33 
 
 
128 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711922  normal  0.253154 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3751  hypothetical protein  55.83 
 
 
134 aa  140  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.576288  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3504  hypothetical protein  54.55 
 
 
129 aa  137  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501161  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0117  protein of unknown function DUF1486  58.97 
 
 
135 aa  135  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0138  hypothetical protein  61.82 
 
 
144 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0652992  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2020  hypothetical protein  52.71 
 
 
132 aa  134  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1830  hypothetical protein  53.33 
 
 
128 aa  133  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.126678  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2636  protein of unknown function DUF1486  54.78 
 
 
128 aa  130  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000287228  hitchhiker  0.00453298 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3154  hypothetical protein  47.9 
 
 
120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.34037  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4758  hypothetical protein  53.98 
 
 
132 aa  122  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4013  hypothetical protein  48.44 
 
 
131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.772114  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1644  hypothetical protein  47.11 
 
 
139 aa  111  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.25271  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1421  hypothetical protein  30.97 
 
 
125 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5664  protein of unknown function DUF1486  30.25 
 
 
257 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1405  protein of unknown function DUF1486  28.32 
 
 
135 aa  47  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5586  protein of unknown function DUF1486  30.58 
 
 
118 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4443  hypothetical protein  29.73 
 
 
132 aa  45.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.253642  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0723  hypothetical protein  32.48 
 
 
147 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00486014 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1179  protein of unknown function DUF1486  26.4 
 
 
153 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4572  protein of unknown function DUF1486  30.36 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1595  hypothetical protein  21.43 
 
 
138 aa  41.6  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000510897  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4520  hypothetical protein  27.05 
 
 
123 aa  41.6  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.38212  normal  0.255709 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0937  hypothetical protein  23.36 
 
 
145 aa  40.8  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.753125  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>