12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1405 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1405  protein of unknown function DUF1486  100 
 
 
135 aa  280  4.0000000000000003e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1031  hypothetical protein  40 
 
 
149 aa  90.5  7e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.95008  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4862  hypothetical protein  28.97 
 
 
128 aa  50.4  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711922  normal  0.253154 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1992  hypothetical protein  29.46 
 
 
132 aa  47.8  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.209953  normal  0.907507 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3504  hypothetical protein  29.41 
 
 
129 aa  47.4  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501161  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4362  protein of unknown function DUF1486  28.32 
 
 
136 aa  47  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.364126 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4758  hypothetical protein  30 
 
 
132 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6225  hypothetical protein  30.7 
 
 
133 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3849  protein of unknown function DUF1486  28.43 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0684  putative taurine dehydrogenase, small subunit  27.43 
 
 
136 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4515  hypothetical protein  28.7 
 
 
134 aa  44.7  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.275606 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2020  hypothetical protein  29.63 
 
 
132 aa  40.4  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>