27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6225 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6225  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  272  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4362  protein of unknown function DUF1486  89.34 
 
 
136 aa  231  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.364126 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1992  hypothetical protein  84.96 
 
 
132 aa  229  9e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.209953  normal  0.907507 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0684  putative taurine dehydrogenase, small subunit  88.52 
 
 
136 aa  227  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4515  hypothetical protein  87.93 
 
 
134 aa  214  4e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.275606 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4728  hypothetical protein  57.14 
 
 
134 aa  160  4.0000000000000004e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.467083  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3751  hypothetical protein  57.02 
 
 
134 aa  141  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.576288  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3849  protein of unknown function DUF1486  57.02 
 
 
140 aa  140  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4862  hypothetical protein  55.83 
 
 
128 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711922  normal  0.253154 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3504  hypothetical protein  53.6 
 
 
129 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501161  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1830  hypothetical protein  52.07 
 
 
128 aa  134  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.126678  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3154  hypothetical protein  49.58 
 
 
120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.34037  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2020  hypothetical protein  53.28 
 
 
132 aa  129  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0138  hypothetical protein  59.09 
 
 
144 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0652992  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0117  protein of unknown function DUF1486  56.9 
 
 
135 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2636  protein of unknown function DUF1486  52.59 
 
 
128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000287228  hitchhiker  0.00453298 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4758  hypothetical protein  55.86 
 
 
132 aa  124  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4013  hypothetical protein  44.44 
 
 
131 aa  117  7e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.772114  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1644  hypothetical protein  46.72 
 
 
139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.25271  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1421  hypothetical protein  31.78 
 
 
125 aa  53.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0723  hypothetical protein  34.19 
 
 
147 aa  47  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00486014 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1405  protein of unknown function DUF1486  30.7 
 
 
135 aa  45.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4572  protein of unknown function DUF1486  30.51 
 
 
146 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5664  protein of unknown function DUF1486  28.45 
 
 
257 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1179  protein of unknown function DUF1486  26.4 
 
 
153 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0937  hypothetical protein  21.31 
 
 
145 aa  41.6  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.753125  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4546  hypothetical protein  28.1 
 
 
132 aa  40.8  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00100705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>