33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4728 on replicon NC_008760
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008760  Pnap_4728  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  281  3.0000000000000004e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.467083  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3849  protein of unknown function DUF1486  63.56 
 
 		 140 aa  169  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0684  putative taurine dehydrogenase, small subunit  60.32 
 
 		 136 aa  167  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3751  hypothetical protein  62.4 
 
 		 134 aa  167  6e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.576288  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4362  protein of unknown function DUF1486  58.73 
 
 		 136 aa  165  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.364126 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1992  hypothetical protein  61.29 
 
 		 132 aa  164  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.209953  normal  0.907507 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6225  hypothetical protein  57.14 
 
 		 133 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4515  hypothetical protein  65.18 
 
 		 134 aa  159  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.275606 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4862  hypothetical protein  55.12 
 
 		 128 aa  155  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711922  normal  0.253154 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2020  hypothetical protein  59.48 
 
 		 132 aa  152  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2636  protein of unknown function DUF1486  64.29 
 
 		 128 aa  150  5.9999999999999996e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000287228  hitchhiker  0.00453298 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3154  hypothetical protein  52.94 
 
 		 120 aa  144  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.34037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3504  hypothetical protein  51.2 
 
 		 129 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501161  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1830  hypothetical protein  51.2 
 
 		 128 aa  138  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.126678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4013  hypothetical protein  48.03 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.772114  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0117  protein of unknown function DUF1486  48.28 
 
 		 135 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0138  hypothetical protein  48.7 
 
 		 144 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0652992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4758  hypothetical protein  45.31 
 
 		 132 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1644  hypothetical protein  44.63 
 
 		 139 aa  108  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.25271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0723  hypothetical protein  31.62 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00486014 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1421  hypothetical protein  28.95 
 
 		 125 aa  51.2  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0937  hypothetical protein  27.68 
 
 		 145 aa  50.4  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.753125  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1179  protein of unknown function DUF1486  29.51 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1595  hypothetical protein  25.62 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000510897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1443  hypothetical protein  32.38 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4572  protein of unknown function DUF1486  27.12 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4546  hypothetical protein  27.73 
 
 		 132 aa  43.5  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00100705  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5586  protein of unknown function DUF1486  31.03 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1039  protein of unknown function DUF1486  24.37 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1610  protein of unknown function DUF1486  31.82 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.692563  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4520  hypothetical protein  25.23 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.38212  normal  0.255709 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5664  protein of unknown function DUF1486  27.73 
 
 		 257 aa  40.8  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3605  hypothetical protein  28.57 
 
 		 128 aa  40  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125588  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>