16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4520 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4520  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  257  4e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.38212  normal  0.255709 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2145  hypothetical protein  57.14 
 
 		 122 aa  150  4e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2643  hypothetical protein  49.14 
 
 		 117 aa  115  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.130845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0816  hypothetical protein  32.43 
 
 		 114 aa  63.9  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0403469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3483  protein of unknown function DUF1486  33.33 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3815  hypothetical protein  30.7 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1067  hypothetical protein  30.36 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.942558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2394  hypothetical protein  25.62 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.358129 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4499  hypothetical protein  30.53 
 
 		 116 aa  47.4  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3356  hypothetical protein  30.89 
 
 		 130 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3418  hypothetical protein  30.89 
 
 		 130 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.451707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3367  hypothetical protein  30.89 
 
 		 130 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1138  limonene-12-epoxide hydrolase  26.55 
 
 		 134 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.866849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4362  protein of unknown function DUF1486  27.05 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.364126 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1317  protein of unknown function DUF1486  25.2 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26628  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4728  hypothetical protein  25.23 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.467083  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>