12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4499 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4499  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  243  4.9999999999999997e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1067  hypothetical protein  63.3 
 
 		 116 aa  150  5e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.942558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0816  hypothetical protein  57.8 
 
 		 114 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0403469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3483  protein of unknown function DUF1486  55.75 
 
 		 116 aa  139  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3815  hypothetical protein  46.73 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3358  hypothetical protein  28.7 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.8978  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3420  hypothetical protein  28.7 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3369  hypothetical protein  28.7 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.915691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4520  hypothetical protein  30.53 
 
 		 123 aa  47.4  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.38212  normal  0.255709 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2145  hypothetical protein  27.72 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2643  hypothetical protein  29.47 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.130845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0937  hypothetical protein  27.03 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.753125  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>