28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3154 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_3154  hypothetical protein  100 
 
 
120 aa  251  3e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.34037  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4728  hypothetical protein  52.94 
 
 
134 aa  144  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.467083  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4362  protein of unknown function DUF1486  47.9 
 
 
136 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.364126 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0684  putative taurine dehydrogenase, small subunit  47.9 
 
 
136 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6225  hypothetical protein  49.58 
 
 
133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3849  protein of unknown function DUF1486  47.86 
 
 
140 aa  128  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1992  hypothetical protein  47.37 
 
 
132 aa  123  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.209953  normal  0.907507 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4515  hypothetical protein  47.75 
 
 
134 aa  121  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.275606 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3751  hypothetical protein  48.72 
 
 
134 aa  121  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.576288  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2636  protein of unknown function DUF1486  48.21 
 
 
128 aa  118  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000287228  hitchhiker  0.00453298 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3504  hypothetical protein  51.38 
 
 
129 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501161  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4862  hypothetical protein  47.06 
 
 
128 aa  117  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711922  normal  0.253154 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1830  hypothetical protein  43.7 
 
 
128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.126678  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4013  hypothetical protein  43.8 
 
 
131 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.772114  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1644  hypothetical protein  44.44 
 
 
139 aa  104  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.25271  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4758  hypothetical protein  39.47 
 
 
132 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2020  hypothetical protein  40.35 
 
 
132 aa  97.8  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0117  protein of unknown function DUF1486  45.61 
 
 
135 aa  98.2  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0138  hypothetical protein  44.74 
 
 
144 aa  97.1  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0652992  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0723  hypothetical protein  31.03 
 
 
147 aa  60.1  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00486014 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1421  hypothetical protein  29.57 
 
 
125 aa  53.5  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1179  protein of unknown function DUF1486  28.33 
 
 
153 aa  52.4  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0937  hypothetical protein  25.89 
 
 
145 aa  47.8  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.753125  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1595  hypothetical protein  21.49 
 
 
138 aa  44.3  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000510897  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0368  hypothetical protein  22.02 
 
 
123 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0222  hypothetical protein  27.35 
 
 
121 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.958256  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1610  protein of unknown function DUF1486  40 
 
 
146 aa  40.4  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.692563  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2641  hypothetical protein  23.23 
 
 
176 aa  40.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0292741  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>