30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1644 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1644  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  288  2e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.25271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4013  hypothetical protein  80 
 
 		 131 aa  221  2e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.772114  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1830  hypothetical protein  61.54 
 
 		 128 aa  170  6.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.126678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3504  hypothetical protein  58.73 
 
 		 129 aa  159  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501161  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4862  hypothetical protein  57.26 
 
 		 128 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711922  normal  0.253154 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6225  hypothetical protein  47.15 
 
 		 133 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0138  hypothetical protein  49.19 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0652992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4362  protein of unknown function DUF1486  47.54 
 
 		 136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.364126 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3751  hypothetical protein  47.54 
 
 		 134 aa  114  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.576288  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1992  hypothetical protein  46.03 
 
 		 132 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.209953  normal  0.907507 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4728  hypothetical protein  43.75 
 
 		 134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.467083  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3849  protein of unknown function DUF1486  45.9 
 
 		 140 aa  110  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0117  protein of unknown function DUF1486  46.83 
 
 		 135 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0684  putative taurine dehydrogenase, small subunit  45.9 
 
 		 136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4515  hypothetical protein  45.69 
 
 		 134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.275606 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4758  hypothetical protein  48.33 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3154  hypothetical protein  42.98 
 
 		 120 aa  104  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.34037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2636  protein of unknown function DUF1486  46.9 
 
 		 128 aa  104  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000287228  hitchhiker  0.00453298 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2020  hypothetical protein  42.74 
 
 		 132 aa  102  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0937  hypothetical protein  28.45 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.753125  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3974  hypothetical protein  30.3 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1031  hypothetical protein  28.71 
 
 		 149 aa  47  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.95008  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1610  protein of unknown function DUF1486  32.77 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.692563  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0723  hypothetical protein  29.06 
 
 		 147 aa  43.9  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00486014 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4443  hypothetical protein  27.18 
 
 		 132 aa  43.5  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.253642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5586  protein of unknown function DUF1486  34.48 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1179  protein of unknown function DUF1486  26.9 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4546  hypothetical protein  28.95 
 
 		 132 aa  41.2  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00100705  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2614  hypothetical protein  31.4 
 
 		 117 aa  40.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2718  protein of unknown function DUF1486  32.69 
 
 		 119 aa  40  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000849743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>