35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_4013 on replicon NC_007488
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007488  RSP_4013  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  269  7e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.772114  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1644  hypothetical protein  80 
 
 		 139 aa  213  9e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.25271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1830  hypothetical protein  62.31 
 
 		 128 aa  170  5e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.126678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3504  hypothetical protein  61.11 
 
 		 129 aa  167  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501161  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4862  hypothetical protein  65.32 
 
 		 128 aa  160  5.0000000000000005e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711922  normal  0.253154 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1992  hypothetical protein  47.69 
 
 		 132 aa  124  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.209953  normal  0.907507 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4728  hypothetical protein  48.03 
 
 		 134 aa  122  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.467083  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3849  protein of unknown function DUF1486  50.41 
 
 		 140 aa  120  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0684  putative taurine dehydrogenase, small subunit  49.61 
 
 		 136 aa  117  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6225  hypothetical protein  44.44 
 
 		 133 aa  117  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4362  protein of unknown function DUF1486  48.44 
 
 		 136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.364126 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4515  hypothetical protein  48.28 
 
 		 134 aa  114  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.275606 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3751  hypothetical protein  45.67 
 
 		 134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.576288  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3154  hypothetical protein  43.8 
 
 		 120 aa  108  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.34037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2020  hypothetical protein  43.41 
 
 		 132 aa  107  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4758  hypothetical protein  48.72 
 
 		 132 aa  106  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2636  protein of unknown function DUF1486  46.9 
 
 		 128 aa  104  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000287228  hitchhiker  0.00453298 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0117  protein of unknown function DUF1486  47.5 
 
 		 135 aa  104  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0138  hypothetical protein  45.08 
 
 		 144 aa  103  8e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0652992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0937  hypothetical protein  27.59 
 
 		 145 aa  53.5  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.753125  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4443  hypothetical protein  33.01 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.253642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3974  hypothetical protein  29.91 
 
 		 131 aa  45.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4546  hypothetical protein  29.17 
 
 		 132 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00100705  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3428  limonene-1,2-epoxide hydrolase  30.25 
 
 		 139 aa  43.5  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1179  protein of unknown function DUF1486  26.67 
 
 		 153 aa  43.5  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5586  protein of unknown function DUF1486  36 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1031  hypothetical protein  27.1 
 
 		 149 aa  42  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.95008  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2718  protein of unknown function DUF1486  33.94 
 
 		 119 aa  42  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000849743  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2520  hypothetical protein  32.08 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.219505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1595  hypothetical protein  26.21 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000510897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1443  hypothetical protein  35.71 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0723  hypothetical protein  28.57 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00486014 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6551  peptidase M20  30.43 
 
 		 354 aa  40.8  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4572  protein of unknown function DUF1486  29.31 
 
 		 146 aa  40.4  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1421  hypothetical protein  35.38 
 
 		 125 aa  40.4  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>