20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0138 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0138  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  286  6e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0652992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0117  protein of unknown function DUF1486  82.09 
 
 		 135 aa  229  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4758  hypothetical protein  57.38 
 
 		 132 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4362  protein of unknown function DUF1486  61.82 
 
 		 136 aa  135  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.364126 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4515  hypothetical protein  60.53 
 
 		 134 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.275606 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1992  hypothetical protein  60.53 
 
 		 132 aa  134  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.209953  normal  0.907507 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0684  putative taurine dehydrogenase, small subunit  60.91 
 
 		 136 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4862  hypothetical protein  53.33 
 
 		 128 aa  128  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711922  normal  0.253154 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6225  hypothetical protein  59.09 
 
 		 133 aa  128  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3849  protein of unknown function DUF1486  55.26 
 
 		 140 aa  127  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4728  hypothetical protein  48.7 
 
 		 134 aa  118  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.467083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3504  hypothetical protein  47.58 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501161  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1830  hypothetical protein  45.97 
 
 		 128 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.126678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3751  hypothetical protein  45.83 
 
 		 134 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.576288  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2020  hypothetical protein  49.12 
 
 		 132 aa  107  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1644  hypothetical protein  48.28 
 
 		 139 aa  105  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.25271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4013  hypothetical protein  45.08 
 
 		 131 aa  103  8e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.772114  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2636  protein of unknown function DUF1486  45.95 
 
 		 128 aa  101  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000287228  hitchhiker  0.00453298 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3154  hypothetical protein  44.74 
 
 		 120 aa  97.1  7e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.34037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1421  hypothetical protein  31.78 
 
 		 125 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>