51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2668 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2668  protein of unknown function DUF1486  100 
 
 
155 aa  316  7e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000361014  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1308  hypothetical protein  52.48 
 
 
158 aa  154  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.225653 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4057  protein of unknown function DUF1486  50 
 
 
187 aa  135  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.846215  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0645  hypothetical protein  52.08 
 
 
145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.272642  normal  0.0449232 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2735  hypothetical protein  51.52 
 
 
195 aa  127  5.0000000000000004e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.513842  normal  0.160119 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2571  protein of unknown function DUF1486  51.52 
 
 
189 aa  122  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276213  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1043  hypothetical protein  45.53 
 
 
125 aa  105  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2641  hypothetical protein  34.56 
 
 
176 aa  81.3  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0292741  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0619  hypothetical protein  35.77 
 
 
143 aa  60.8  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.15035  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1691  protein of unknown function DUF1486  36.36 
 
 
139 aa  56.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4245  hypothetical protein  31.97 
 
 
176 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.13713 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5540  protein of unknown function DUF1486  31.91 
 
 
138 aa  51.2  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2393  hypothetical protein  25.87 
 
 
169 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000832802  normal  0.0699351 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1624  hypothetical protein  32.97 
 
 
151 aa  50.8  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000580657 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1757  protein of unknown function DUF1486  32.31 
 
 
156 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4029  hypothetical protein  26.21 
 
 
169 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1686  protein of unknown function DUF1486  31.54 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4153  hypothetical protein  34.29 
 
 
138 aa  49.7  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.870281  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2975  hypothetical protein  33.7 
 
 
152 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.903707  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2716  hypothetical protein  40.74 
 
 
181 aa  48.1  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2282  hypothetical protein  27.2 
 
 
144 aa  47.8  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.182969  normal  0.14017 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2161  protein of unknown function DUF1486  37.18 
 
 
123 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395088  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0498  hypothetical protein  32.08 
 
 
145 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.0035037  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2192  hypothetical protein  30.53 
 
 
156 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.206741  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0659  protein of unknown function DUF1486  32.08 
 
 
145 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.984641  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5286  hypothetical protein  31.87 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0952  protein of unknown function DUF1486  29.41 
 
 
149 aa  45.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0666254  decreased coverage  0.00444563 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  37.31 
 
 
407 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2666  protein of unknown function DUF1486  33.33 
 
 
142 aa  44.7  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0080  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.04 
 
 
316 aa  44.7  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3219  protein of unknown function DUF1486  27.1 
 
 
148 aa  44.3  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247367  hitchhiker  0.000405951 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  37.31 
 
 
407 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3047  hypothetical protein  36.47 
 
 
139 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.569819  normal  0.766328 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26760  predicted ester cyclase  32.97 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.683774  normal  0.316469 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1039  protein of unknown function DUF1486  26.73 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7175  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase)(DLH)  39.53 
 
 
410 aa  43.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2641  hypothetical protein  32.14 
 
 
332 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.677673  normal  0.0276572 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3428  limonene-1,2-epoxide hydrolase  32.5 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1595  hypothetical protein  28.16 
 
 
138 aa  43.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000510897  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1300  hypothetical protein  24.44 
 
 
172 aa  42  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.968882  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3321  dienelactone hydrolase  39.53 
 
 
409 aa  42.4  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1646  protein of unknown function DUF1486  29.67 
 
 
152 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.081161  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3956  hypothetical protein  36.92 
 
 
413 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29420  hypothetical protein  36.92 
 
 
413 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1719  protein of unknown function DUF1486  28.57 
 
 
152 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1391  hypothetical protein  36.36 
 
 
178 aa  40.8  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1605  hypothetical protein  36.36 
 
 
179 aa  41.2  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0339  protein of unknown function DUF1486  35.71 
 
 
137 aa  40.4  0.008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.175362  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  39.53 
 
 
409 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07470  dienelactone hydrolase (AFU_orthologue; AFUA_2G05810)  29.17 
 
 
430 aa  40.8  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.507136  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3271  hypothetical protein  32.76 
 
 
142 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>