36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1198 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1198  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  324  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198926  normal  0.424517 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5410  protein of unknown function DUF1486  89.57 
 
 		 163 aa  298  3e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.691604  normal  0.630541 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1127  hypothetical protein  80.39 
 
 		 157 aa  252  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.236072 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5607  hypothetical protein  77.78 
 
 		 157 aa  248  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.206103  normal  0.841881 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3674  hypothetical protein  77.78 
 
 		 157 aa  248  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0168299  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4693  hypothetical protein  77.78 
 
 		 157 aa  248  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0146781  normal  0.148088 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5328  hypothetical protein  68.39 
 
 		 157 aa  226  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0131441 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3555  hypothetical protein  69.93 
 
 		 156 aa  219  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.159937 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0979  hypothetical protein  66 
 
 		 157 aa  213  7e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1261  hypothetical protein  64.9 
 
 		 174 aa  213  8e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.190288  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0978  hypothetical protein  62.18 
 
 		 158 aa  210  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.71902  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0971  hypothetical protein  61.54 
 
 		 158 aa  208  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14130  hypothetical protein  66.44 
 
 		 160 aa  207  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0339955  normal  0.12705 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4245  hypothetical protein  62.99 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1010  hypothetical protein  60.9 
 
 		 158 aa  205  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1079  hypothetical protein  68.21 
 
 		 163 aa  204  4e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1255  hypothetical protein  65.77 
 
 		 160 aa  185  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2583  hypothetical protein  44.37 
 
 		 158 aa  158  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2797  hypothetical protein  45.45 
 
 		 156 aa  158  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3730  hypothetical protein  44.24 
 
 		 171 aa  139  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0347674 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0482  hypothetical protein  47.8 
 
 		 165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6429  hypothetical protein  44.67 
 
 		 164 aa  131  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1448  hypothetical protein  42.21 
 
 		 162 aa  124  5e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4477  hypothetical protein  44.87 
 
 		 174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl176  hypothetical protein  34.65 
 
 		 150 aa  99  2e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0546  hypothetical protein  29.2 
 
 		 156 aa  50.8  0.000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000563714  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4153  hypothetical protein  28.06 
 
 		 138 aa  48.9  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.870281  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0596  hypothetical protein  31.75 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2281  hypothetical protein  30.95 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.30011 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1070  hypothetical protein  27.2 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0629  hypothetical protein  30.95 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.91146  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1039  protein of unknown function DUF1486  27.82 
 
 		 144 aa  43.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4737  hypothetical protein  25.19 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.870255  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1060  protein of unknown function DUF1486  29.92 
 
 		 159 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.148569  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0464  hypothetical protein  28.24 
 
 		 148 aa  41.2  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0165  hypothetical protein  39.62 
 
 		 125 aa  40.8  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>