31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4245 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4245  hypothetical protein  100 
 
 
176 aa  364  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.13713 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2282  hypothetical protein  38.24 
 
 
144 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.182969  normal  0.14017 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1039  protein of unknown function DUF1486  37.96 
 
 
144 aa  103  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3428  limonene-1,2-epoxide hydrolase  36.97 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4712  protein of unknown function DUF1486  33.58 
 
 
139 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.719641 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1691  protein of unknown function DUF1486  30.43 
 
 
139 aa  59.7  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0619  hypothetical protein  33.33 
 
 
143 aa  58.5  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.15035  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2313  hypothetical protein  38.24 
 
 
145 aa  58.9  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2668  protein of unknown function DUF1486  31.97 
 
 
155 aa  56.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000361014  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1177  protein of unknown function DUF1486  35.71 
 
 
145 aa  51.6  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.266373  normal  0.621236 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2735  hypothetical protein  32.91 
 
 
195 aa  48.1  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.513842  normal  0.160119 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4057  protein of unknown function DUF1486  31.67 
 
 
187 aa  48.1  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.846215  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1645  limonene-1,2-epoxide hydrolase catalytic domain-contain protein  24.14 
 
 
1420 aa  48.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3974  hypothetical protein  26.67 
 
 
131 aa  47.8  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2641  hypothetical protein  25.76 
 
 
176 aa  47.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0292741  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2975  hypothetical protein  31.52 
 
 
152 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.903707  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3271  hypothetical protein  24.22 
 
 
142 aa  45.1  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2571  protein of unknown function DUF1486  31.09 
 
 
189 aa  45.4  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276213  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2307  protein of unknown function DUF1486  32.18 
 
 
204 aa  44.3  0.0009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0776  protein of unknown function DUF1486  30.53 
 
 
174 aa  43.9  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.181215 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0952  protein of unknown function DUF1486  32 
 
 
149 aa  43.5  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0666254  decreased coverage  0.00444563 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5540  protein of unknown function DUF1486  27.21 
 
 
138 aa  43.9  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1646  protein of unknown function DUF1486  30.86 
 
 
152 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.081161  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1719  protein of unknown function DUF1486  30.86 
 
 
152 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0931  hypothetical protein  27.55 
 
 
140 aa  42.7  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0249  hypothetical protein  29.52 
 
 
150 aa  42.4  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000330917  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1078  beta-lactamase domain protein  23.91 
 
 
402 aa  42  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.123154  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0080  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.87 
 
 
316 aa  41.6  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5286  hypothetical protein  25.95 
 
 
137 aa  42  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6742  protein of unknown function DUF1486  25.53 
 
 
144 aa  40.8  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2953  ester cyclase-like  29.33 
 
 
138 aa  40.8  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>