49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4924 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4924  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  314  3e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5449  hypothetical protein  85.81 
 
 
155 aa  274  3e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0317  protein of unknown function DUF1486  86.39 
 
 
153 aa  263  5e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.478711 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5713  protein of unknown function DUF1486  86.39 
 
 
153 aa  261  4e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4917  hypothetical protein  82.99 
 
 
149 aa  258  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5286  hypothetical protein  35.97 
 
 
137 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2666  protein of unknown function DUF1486  33.33 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0441  hypothetical protein  30.22 
 
 
144 aa  62  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664223  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2161  protein of unknown function DUF1486  33.33 
 
 
123 aa  59.7  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395088  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2975  hypothetical protein  36.99 
 
 
152 aa  58.9  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.903707  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1624  hypothetical protein  33.8 
 
 
151 aa  57.8  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000580657 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4210  hypothetical protein  34.91 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6742  protein of unknown function DUF1486  32.54 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1646  protein of unknown function DUF1486  32.45 
 
 
152 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.081161  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1719  protein of unknown function DUF1486  32.45 
 
 
152 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5540  protein of unknown function DUF1486  27.08 
 
 
138 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0295  protein of unknown function DUF1486  32.41 
 
 
148 aa  52.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26760  predicted ester cyclase  32.61 
 
 
140 aa  51.2  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.683774  normal  0.316469 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6384  hypothetical protein  29.86 
 
 
147 aa  50.8  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.792832  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0931  hypothetical protein  28.26 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2545  protein of unknown function DUF1486  30 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0498  hypothetical protein  28.57 
 
 
145 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.0035037  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0659  protein of unknown function DUF1486  28.57 
 
 
145 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.984641  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4925  hypothetical protein  30.77 
 
 
137 aa  48.5  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773252  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0351  protein of unknown function DUF1486  25.87 
 
 
145 aa  48.1  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0316  protein of unknown function DUF1486  29.25 
 
 
138 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1261  protein of unknown function DUF1486  30.87 
 
 
182 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00537261  normal  0.341449 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0249  hypothetical protein  35.79 
 
 
150 aa  47.8  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000330917  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0080  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.5 
 
 
316 aa  47.8  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1039  protein of unknown function DUF1486  34 
 
 
144 aa  47.4  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1022  putative lipoprotein  31 
 
 
179 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4914  hypothetical protein  32.89 
 
 
137 aa  47  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.208327  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0797  putative lipoprotein  31 
 
 
182 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.430815  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0837  putative lipoprotein  31 
 
 
179 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.461005  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26927  predicted protein  28.47 
 
 
242 aa  45.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00169388  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4442  putative lipoprotein  31 
 
 
179 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.987994  normal  0.460875 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0741  hypothetical protein  30 
 
 
182 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5626  protein of unknown function DUF1486  29.41 
 
 
147 aa  44.3  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0749  hypothetical protein  30 
 
 
179 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3219  protein of unknown function DUF1486  30.4 
 
 
148 aa  43.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247367  hitchhiker  0.000405951 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1107  protein of unknown function DUF1486  35.11 
 
 
163 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0892  putative lipoprotein  30 
 
 
179 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0930  putative lipoprotein  30 
 
 
179 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0932  putative lipoprotein  28 
 
 
179 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6654500000000002e-29 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0746  hypothetical protein  28 
 
 
182 aa  41.2  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00470157  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0952  protein of unknown function DUF1486  35.71 
 
 
149 aa  40.8  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0666254  decreased coverage  0.00444563 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0713  hypothetical protein  27.56 
 
 
114 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0424075 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0699  hypothetical protein  27.56 
 
 
114 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2307  protein of unknown function DUF1486  33.94 
 
 
204 aa  40.4  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>