44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5713 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5713  protein of unknown function DUF1486  100 
 
 		 153 aa  310  5.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0317  protein of unknown function DUF1486  95.42 
 
 		 153 aa  300  4.0000000000000003e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.478711 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4924  hypothetical protein  86.39 
 
 		 155 aa  261  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4917  hypothetical protein  80.14 
 
 		 149 aa  245  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5449  hypothetical protein  79.73 
 
 		 155 aa  243  9e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0441  hypothetical protein  32.5 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6742  protein of unknown function DUF1486  32.54 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2161  protein of unknown function DUF1486  32.61 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395088  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4210  hypothetical protein  31.67 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5286  hypothetical protein  34.07 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1624  hypothetical protein  32.19 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000580657 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2666  protein of unknown function DUF1486  33.56 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5626  protein of unknown function DUF1486  31.58 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6384  hypothetical protein  29.79 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.792832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0249  hypothetical protein  30.94 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000330917  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2975  hypothetical protein  32.65 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.903707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4925  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5540  protein of unknown function DUF1486  26.06 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1646  protein of unknown function DUF1486  31.03 
 
 		 152 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.081161  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1719  protein of unknown function DUF1486  31.03 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26760  predicted ester cyclase  30.95 
 
 		 140 aa  49.7  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.683774  normal  0.316469 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0797  putative lipoprotein  33 
 
 		 182 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.430815  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0837  putative lipoprotein  33 
 
 		 179 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.461005  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0351  protein of unknown function DUF1486  26.76 
 
 		 145 aa  48.1  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4442  putative lipoprotein  33 
 
 		 179 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.987994  normal  0.460875 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1022  putative lipoprotein  32 
 
 		 179 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0749  hypothetical protein  32 
 
 		 179 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0295  protein of unknown function DUF1486  30.08 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2545  protein of unknown function DUF1486  31.08 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0080  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.37 
 
 		 316 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0741  hypothetical protein  31 
 
 		 182 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0892  putative lipoprotein  32 
 
 		 179 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0931  hypothetical protein  27.05 
 
 		 140 aa  43.9  0.0009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1261  protein of unknown function DUF1486  37.08 
 
 		 182 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00537261  normal  0.341449 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3489  heat domain-containing protein  26.26 
 
 		 366 aa  43.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0930  putative lipoprotein  31 
 
 		 179 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26927  predicted protein  27.78 
 
 		 242 aa  42.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00169388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0316  protein of unknown function DUF1486  27.21 
 
 		 138 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5397  hypothetical protein  29.2 
 
 		 187 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255025  normal  0.733155 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4914  hypothetical protein  30.41 
 
 		 137 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.208327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0932  putative lipoprotein  29 
 
 		 179 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6654500000000002e-29 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1710  hypothetical protein  29.03 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.518536  normal  0.0462427 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0746  hypothetical protein  29 
 
 		 182 aa  41.6  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00470157  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3974  hypothetical protein  30.95 
 
 		 131 aa  40.8  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>