44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0317 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0317  protein of unknown function DUF1486  100 
 
 
153 aa  311  1.9999999999999998e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.478711 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5713  protein of unknown function DUF1486  95.42 
 
 
153 aa  300  4.0000000000000003e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4924  hypothetical protein  86.39 
 
 
155 aa  263  5e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4917  hypothetical protein  82.19 
 
 
149 aa  249  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5449  hypothetical protein  79.73 
 
 
155 aa  245  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0441  hypothetical protein  35.54 
 
 
144 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664223  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2161  protein of unknown function DUF1486  33.33 
 
 
123 aa  61.2  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395088  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6742  protein of unknown function DUF1486  31.75 
 
 
144 aa  60.8  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2666  protein of unknown function DUF1486  33.56 
 
 
142 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1624  hypothetical protein  32.87 
 
 
151 aa  57  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000580657 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5286  hypothetical protein  35.25 
 
 
137 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6384  hypothetical protein  30.5 
 
 
147 aa  55.5  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.792832  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4210  hypothetical protein  36.56 
 
 
144 aa  53.9  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0249  hypothetical protein  30.94 
 
 
150 aa  53.5  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000330917  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5540  protein of unknown function DUF1486  26.76 
 
 
138 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2975  hypothetical protein  32.65 
 
 
152 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.903707  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1719  protein of unknown function DUF1486  31.72 
 
 
152 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1646  protein of unknown function DUF1486  31.72 
 
 
152 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.081161  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4925  hypothetical protein  34.69 
 
 
137 aa  51.6  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773252  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26760  predicted ester cyclase  31.75 
 
 
140 aa  51.6  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.683774  normal  0.316469 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5626  protein of unknown function DUF1486  30.88 
 
 
147 aa  50.8  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2545  protein of unknown function DUF1486  32.43 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0295  protein of unknown function DUF1486  33.06 
 
 
148 aa  48.9  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0080  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.07 
 
 
316 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0797  putative lipoprotein  32 
 
 
182 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.430815  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0837  putative lipoprotein  32 
 
 
179 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.461005  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4442  putative lipoprotein  32 
 
 
179 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.987994  normal  0.460875 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1022  putative lipoprotein  31 
 
 
179 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0351  protein of unknown function DUF1486  26.06 
 
 
145 aa  45.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0749  hypothetical protein  31 
 
 
179 aa  45.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0931  hypothetical protein  26.83 
 
 
140 aa  45.1  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26927  predicted protein  29.66 
 
 
242 aa  44.3  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00169388  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0741  hypothetical protein  30 
 
 
182 aa  44.3  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0892  putative lipoprotein  31 
 
 
179 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3489  heat domain-containing protein  26.26 
 
 
366 aa  43.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5397  hypothetical protein  29.93 
 
 
187 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255025  normal  0.733155 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4914  hypothetical protein  31.08 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.208327  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1261  protein of unknown function DUF1486  35.96 
 
 
182 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00537261  normal  0.341449 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1039  protein of unknown function DUF1486  33 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1710  hypothetical protein  29.84 
 
 
142 aa  42  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.518536  normal  0.0462427 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0316  protein of unknown function DUF1486  28.28 
 
 
138 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0930  putative lipoprotein  30 
 
 
179 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1107  protein of unknown function DUF1486  37.21 
 
 
163 aa  41.6  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3974  hypothetical protein  25.71 
 
 
131 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>