49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5449 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5449  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  315  1e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4924  hypothetical protein  85.81 
 
 		 155 aa  274  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4917  hypothetical protein  78.91 
 
 		 149 aa  248  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0317  protein of unknown function DUF1486  79.73 
 
 		 153 aa  245  1e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.478711 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5713  protein of unknown function DUF1486  79.73 
 
 		 153 aa  243  9e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0441  hypothetical protein  32 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0351  protein of unknown function DUF1486  29.79 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2161  protein of unknown function DUF1486  34.06 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395088  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4210  hypothetical protein  29.85 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1646  protein of unknown function DUF1486  33.33 
 
 		 152 aa  57  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.081161  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1624  hypothetical protein  34.75 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000580657 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1719  protein of unknown function DUF1486  33.33 
 
 		 152 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6384  hypothetical protein  31.91 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.792832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4925  hypothetical protein  32.41 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6742  protein of unknown function DUF1486  32.52 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2975  hypothetical protein  35.86 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.903707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5286  hypothetical protein  32.67 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0931  hypothetical protein  30.88 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0295  protein of unknown function DUF1486  31.65 
 
 		 148 aa  50.8  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0080  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.22 
 
 		 316 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2666  protein of unknown function DUF1486  33.96 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0713  hypothetical protein  30.65 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0424075 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0249  hypothetical protein  35.56 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000330917  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0699  hypothetical protein  30.65 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26760  predicted ester cyclase  32.33 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.683774  normal  0.316469 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0837  putative lipoprotein  34.83 
 
 		 179 aa  48.1  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.461005  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1039  protein of unknown function DUF1486  33.02 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0797  putative lipoprotein  34.83 
 
 		 182 aa  48.1  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.430815  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4442  putative lipoprotein  34.83 
 
 		 179 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.987994  normal  0.460875 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0693  hypothetical protein  29.84 
 
 		 114 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0235649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1022  putative lipoprotein  33.71 
 
 		 179 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4914  hypothetical protein  30.07 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.208327  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0741  hypothetical protein  33.71 
 
 		 182 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0316  protein of unknown function DUF1486  30.61 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0749  hypothetical protein  31 
 
 		 179 aa  45.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0892  putative lipoprotein  33.71 
 
 		 179 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5540  protein of unknown function DUF1486  27.27 
 
 		 138 aa  43.9  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3219  protein of unknown function DUF1486  27.89 
 
 		 148 aa  43.9  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247367  hitchhiker  0.000405951 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5626  protein of unknown function DUF1486  33.33 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2585  protein of unknown function DUF1486  27.59 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000118925  hitchhiker  0.000130504 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1610  protein of unknown function DUF1486  26.87 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.692563  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3974  hypothetical protein  27.66 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2307  protein of unknown function DUF1486  33.94 
 
 		 204 aa  43.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2545  protein of unknown function DUF1486  28.38 
 
 		 139 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0930  putative lipoprotein  32.58 
 
 		 179 aa  42  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0932  putative lipoprotein  30.34 
 
 		 179 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6654500000000002e-29 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5397  hypothetical protein  33.33 
 
 		 187 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255025  normal  0.733155 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0746  hypothetical protein  30.34 
 
 		 182 aa  41.2  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00470157  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0915  protein of unknown function DUF1486  29.17 
 
 		 138 aa  40.4  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.282506  normal  0.0578966 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>