52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2307 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2307  protein of unknown function DUF1486  100 
 
 
204 aa  414  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0295  protein of unknown function DUF1486  33.1 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0316  protein of unknown function DUF1486  30 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3560  protein of unknown function DUF1486  36.63 
 
 
173 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1261  protein of unknown function DUF1486  27.03 
 
 
182 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00537261  normal  0.341449 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26760  predicted ester cyclase  25.83 
 
 
140 aa  57.8  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.683774  normal  0.316469 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4651  hypothetical protein  26.72 
 
 
186 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5540  protein of unknown function DUF1486  27.14 
 
 
138 aa  56.6  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2604  hypothetical protein  33.09 
 
 
186 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5397  hypothetical protein  31.25 
 
 
187 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255025  normal  0.733155 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1710  hypothetical protein  27.52 
 
 
142 aa  55.5  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.518536  normal  0.0462427 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1447  hypothetical protein  30.94 
 
 
185 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0560331  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2545  protein of unknown function DUF1486  28 
 
 
139 aa  54.3  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1104  hypothetical protein  30.61 
 
 
185 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0489751  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0955  hypothetical protein  30.61 
 
 
185 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.949837  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1729  hypothetical protein  31.25 
 
 
185 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0373687  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0209  hypothetical protein  30.61 
 
 
185 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0131745  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1882  hypothetical protein  31.25 
 
 
185 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0563369  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1546  hypothetical protein  30.61 
 
 
185 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1703  hypothetical protein  31.25 
 
 
185 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1078  beta-lactamase domain protein  31.06 
 
 
402 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.123154  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1394  hypothetical protein  30.77 
 
 
185 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.984832  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1354  hypothetical protein  30.22 
 
 
185 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2161  protein of unknown function DUF1486  30.68 
 
 
123 aa  50.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395088  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1469  hypothetical protein  32.32 
 
 
185 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0987  hypothetical protein  32.32 
 
 
185 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.983826  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0931  hypothetical protein  25.9 
 
 
140 aa  49.7  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5224  hypothetical protein  27.54 
 
 
148 aa  49.3  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4210  hypothetical protein  31.25 
 
 
144 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0915  protein of unknown function DUF1486  28.87 
 
 
138 aa  47.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.282506  normal  0.0578966 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3371  hypothetical protein  29.17 
 
 
133 aa  47.4  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.032421  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3219  protein of unknown function DUF1486  27.52 
 
 
148 aa  47  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247367  hitchhiker  0.000405951 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6384  hypothetical protein  26.35 
 
 
147 aa  46.6  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.792832  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2801  protein of unknown function DUF1486  27.69 
 
 
181 aa  45.1  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.19615  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2394  protein of unknown function DUF1486  27.69 
 
 
180 aa  45.1  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4245  hypothetical protein  32.18 
 
 
176 aa  45.1  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.13713 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0996  protein of unknown function DUF1486  28.07 
 
 
173 aa  45.1  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5286  hypothetical protein  24.66 
 
 
137 aa  44.7  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4917  hypothetical protein  35.64 
 
 
149 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3693  hypothetical protein  26.56 
 
 
214 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3928  protein of unknown function DUF1486  30.77 
 
 
157 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.106321 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1624  hypothetical protein  25.69 
 
 
151 aa  42.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000580657 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1107  protein of unknown function DUF1486  29.35 
 
 
163 aa  42.4  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5449  hypothetical protein  35.14 
 
 
155 aa  42.7  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3428  limonene-1,2-epoxide hydrolase  29.25 
 
 
139 aa  42.4  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5626  protein of unknown function DUF1486  22.52 
 
 
147 aa  42.4  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0441  hypothetical protein  27.78 
 
 
144 aa  42.4  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664223  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1646  protein of unknown function DUF1486  29.68 
 
 
152 aa  41.6  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.081161  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1719  protein of unknown function DUF1486  29.68 
 
 
152 aa  41.6  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2975  hypothetical protein  30.61 
 
 
152 aa  41.6  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.903707  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0892  putative lipoprotein  22.76 
 
 
179 aa  41.6  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0455  hypothetical protein  29.9 
 
 
212 aa  41.2  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>