52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1107 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1107  protein of unknown function DUF1486  100 
 
 		 163 aa  333  3.9999999999999995e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5626  protein of unknown function DUF1486  28.57 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3974  hypothetical protein  28.68 
 
 		 131 aa  70.5  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3219  protein of unknown function DUF1486  29.86 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247367  hitchhiker  0.000405951 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26760  predicted ester cyclase  35.63 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.683774  normal  0.316469 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2666  protein of unknown function DUF1486  32.61 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2545  protein of unknown function DUF1486  28.15 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4678  protein of unknown function DUF1486  33.04 
 
 		 141 aa  57  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000675641 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5540  protein of unknown function DUF1486  31.25 
 
 		 138 aa  57  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0316  protein of unknown function DUF1486  26.12 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0952  protein of unknown function DUF1486  26.61 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0666254  decreased coverage  0.00444563 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1624  hypothetical protein  37.35 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000580657 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6384  hypothetical protein  28.91 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.792832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1261  protein of unknown function DUF1486  33.75 
 
 		 182 aa  52.4  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00537261  normal  0.341449 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4210  hypothetical protein  37.88 
 
 		 144 aa  51.6  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5397  hypothetical protein  35.9 
 
 		 187 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255025  normal  0.733155 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0441  hypothetical protein  27.83 
 
 		 144 aa  50.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0339  protein of unknown function DUF1486  25.21 
 
 		 137 aa  49.7  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.175362  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2975  hypothetical protein  37.5 
 
 		 152 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.903707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0498  hypothetical protein  24.43 
 
 		 145 aa  48.1  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.0035037  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0659  protein of unknown function DUF1486  24.43 
 
 		 145 aa  48.1  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.984641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5286  hypothetical protein  33.75 
 
 		 137 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5476  hypothetical protein  28.57 
 
 		 128 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.880512  normal  0.34526 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1691  protein of unknown function DUF1486  22.83 
 
 		 139 aa  47  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4925  hypothetical protein  26.52 
 
 		 137 aa  47  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0561  hypothetical protein  30.19 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6742  protein of unknown function DUF1486  33.73 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1710  hypothetical protein  30.77 
 
 		 142 aa  45.8  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.518536  normal  0.0462427 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0351  protein of unknown function DUF1486  23.08 
 
 		 145 aa  45.4  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2604  hypothetical protein  31.58 
 
 		 186 aa  44.7  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1394  hypothetical protein  29.27 
 
 		 185 aa  44.3  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.984832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3560  protein of unknown function DUF1486  33 
 
 		 173 aa  44.3  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0249  hypothetical protein  34.67 
 
 		 150 aa  44.3  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000330917  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1354  hypothetical protein  29.27 
 
 		 185 aa  44.3  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0080  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.38 
 
 		 316 aa  43.9  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0915  protein of unknown function DUF1486  30 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.282506  normal  0.0578966 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26927  predicted protein  25 
 
 		 242 aa  43.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00169388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3928  protein of unknown function DUF1486  28.21 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.106321 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2638  hypothetical protein  27.33 
 
 		 174 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0675425  normal  0.0108071 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2307  protein of unknown function DUF1486  29.35 
 
 		 204 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4914  hypothetical protein  29.11 
 
 		 137 aa  43.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.208327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1646  protein of unknown function DUF1486  32.18 
 
 		 152 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.081161  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4651  hypothetical protein  28.09 
 
 		 186 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1719  protein of unknown function DUF1486  32.18 
 
 		 152 aa  42  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2161  protein of unknown function DUF1486  29.76 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395088  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0931  hypothetical protein  32 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0317  protein of unknown function DUF1486  37.21 
 
 		 153 aa  41.6  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.478711 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4924  hypothetical protein  35.11 
 
 		 155 aa  41.2  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2801  protein of unknown function DUF1486  30.26 
 
 		 181 aa  40.8  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.19615  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0819  hypothetical protein  33.75 
 
 		 134 aa  40.8  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4917  hypothetical protein  36.05 
 
 		 149 aa  40.8  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3310  hypothetical protein  28.38 
 
 		 156 aa  40.4  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0294644 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>