16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2735 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2735  hypothetical protein  100 
 
 
195 aa  398  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.513842  normal  0.160119 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2571  protein of unknown function DUF1486  67.98 
 
 
189 aa  249  1e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276213  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4057  protein of unknown function DUF1486  66.67 
 
 
187 aa  244  4e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.846215  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1308  hypothetical protein  49.64 
 
 
158 aa  144  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.225653 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2668  protein of unknown function DUF1486  51.52 
 
 
155 aa  127  9.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000361014  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0645  hypothetical protein  45 
 
 
145 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.272642  normal  0.0449232 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1043  hypothetical protein  35.94 
 
 
125 aa  73.2  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2641  hypothetical protein  31.47 
 
 
176 aa  66.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0292741  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2393  hypothetical protein  27.81 
 
 
169 aa  59.3  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000832802  normal  0.0699351 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4029  hypothetical protein  27.74 
 
 
169 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4245  hypothetical protein  32.91 
 
 
176 aa  48.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.13713 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1039  protein of unknown function DUF1486  29.63 
 
 
144 aa  47  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2282  hypothetical protein  25.44 
 
 
144 aa  44.3  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.182969  normal  0.14017 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0441  hypothetical protein  41.18 
 
 
144 aa  43.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664223  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1691  protein of unknown function DUF1486  35.29 
 
 
139 aa  41.6  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1595  hypothetical protein  26.79 
 
 
138 aa  41.2  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000510897  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>