16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2571 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2571  protein of unknown function DUF1486  100 
 
 		 189 aa  378  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276213  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2735  hypothetical protein  67.98 
 
 		 195 aa  249  1e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.513842  normal  0.160119 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4057  protein of unknown function DUF1486  61.75 
 
 		 187 aa  238  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.846215  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1308  hypothetical protein  53.57 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.225653 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2668  protein of unknown function DUF1486  51.52 
 
 		 155 aa  122  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000361014  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0645  hypothetical protein  45.59 
 
 		 145 aa  114  8.999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.272642  normal  0.0449232 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1043  hypothetical protein  39.68 
 
 		 125 aa  80.5  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2641  hypothetical protein  34.88 
 
 		 176 aa  73.9  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0292741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2393  hypothetical protein  29.38 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000832802  normal  0.0699351 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4029  hypothetical protein  27.5 
 
 		 169 aa  52.4  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2716  hypothetical protein  32.45 
 
 		 181 aa  45.4  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4245  hypothetical protein  31.09 
 
 		 176 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.13713 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3180  carboxymethylenebutenolidase  32.41 
 
 		 433 aa  45.1  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000051009  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2975  hypothetical protein  33.33 
 
 		 152 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.903707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1691  protein of unknown function DUF1486  35.48 
 
 		 139 aa  42.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3321  dienelactone hydrolase  30.34 
 
 		 409 aa  41.6  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>