14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0645 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0645  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  300  4.0000000000000003e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.272642  normal  0.0449232 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2668  protein of unknown function DUF1486  52.08 
 
 		 155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000361014  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4057  protein of unknown function DUF1486  43.97 
 
 		 187 aa  117  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.846215  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2571  protein of unknown function DUF1486  45.59 
 
 		 189 aa  114  5e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276213  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2735  hypothetical protein  45 
 
 		 195 aa  113  7.999999999999999e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.513842  normal  0.160119 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1308  hypothetical protein  42.55 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.225653 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2641  hypothetical protein  32.17 
 
 		 176 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0292741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1043  hypothetical protein  34.59 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4712  protein of unknown function DUF1486  29.03 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.719641 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1605  hypothetical protein  31.31 
 
 		 179 aa  45.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1391  hypothetical protein  31.31 
 
 		 178 aa  45.1  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2282  hypothetical protein  28.04 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.182969  normal  0.14017 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2716  hypothetical protein  31.65 
 
 		 181 aa  41.2  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1078  beta-lactamase domain protein  27.97 
 
 		 402 aa  40.4  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.123154  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>